Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> nabia >> ruby >> ruby-fix-trinity-output
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: ruby-fix-trinity-output  ]

Pakiet: ruby-fix-trinity-output (1.0.0-2)

Fix output fastq files from trinityrnaseq

trinityrnaseq outputs fastq files that have been 'corrected'

Unfortunately these files are no longer properly paired and therefore can't be used in most aligners such as bowtie2 and snap-aligner. This script attempts to fix that and produce 2 properly paired fastq files and a fastq file containing single reads

Inne pakiety związane z ruby-fix-trinity-output

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: ruby
    Interpreter of object-oriented scripting language Ruby (default version)
    lub ruby-interpreter
    Pakiet niedostępny
  • dep: ruby-trollop (>= 2.0)
    command-line argument processing library

Pobieranie ruby-fix-trinity-output

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
all 5,0 KiB30 KiB [lista plików]