Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> nabia >> science >> clustalw
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: clustalw  ]

Pakiet: clustalw (2.1+lgpl-6build1)

global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

This program performs an alignment of multiple nucleotide or amino acid sequences. It recognizes the format of input sequences and whether the sequences are nucleic acid (DNA/RNA) or amino acid (proteins). The output format may be selected from in various formats for multiple alignments such as Phylip or FASTA. Clustal W is very well accepted.

The output of Clustal W can be edited manually but preferably with an alignment editor like SeaView or within its companion Clustal X. When building a model from your alignment, this can be applied for improved database searches. The Debian package hmmer creates such in form of an HMM.

Inne pakiety związane z clustalw

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.29)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
    GCC support library
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3
  • sug: clustalx
    Pakiet niedostępny
  • sug: seaview
    Pakiet niedostępny
  • enh: bioperl-run
    BioPerl wrappers: scripts
  • enh: emboss
    European molecular biology open software suite
  • enh: t-coffee
    Multiple Sequence Alignment

Pobieranie clustalw

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 272,3 KiB799 KiB [lista plików]