Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> ecne (12.0LTS) >> python >> python3-pyabpoa
[  ecne  ] [  xolotl  ]
[ Pakiet źródłowy: abpoa  ]

Pakiet: python3-pyabpoa (1.5.1-1build1)

Odnośniki dla python3-pyabpoa

python3-pyabpoa

Zasoby systemu Trisquel:

Pobieranie pakietu źródłowego abpoa:

Opiekun:

Original Maintainers:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

adaptive banded Partial Order Alignment - python3 module

abPOA is an extended version of Partial Order Alignment (POA) that performs adaptive banded dynamic programming (DP) with an SIMD implementation. abPOA can perform multiple sequence alignment (MSA) on a set of input sequences and generate a consensus sequence by applying the heaviest bundling algorithm to the final alignment graph.

abPOA can generate high-quality consensus sequences from error-prone long reads and offer significant speed improvement over existing tools.

abPOA supports three alignment modes (global, local, extension) and flexible scoring schemes that allow linear, affine and convex gap penalties. It right now supports SSE2/SSE4.1/AVX2 vectorization.

This package provides the python3 module of abPOA.

Inne pakiety związane z python3-pyabpoa

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.33)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • dep: python3 (<< 3.13)
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
    dep: python3 (>= 3.12~)
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

Pobieranie python3-pyabpoa

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 166,4 KiB420 KiB [lista plików]
arm64 154,5 KiB412 KiB [lista plików]
ppc64el 181,2 KiB476 KiB [lista plików]
riscv64 193,8 KiB384 KiB [lista plików]