Pakiet: murasaki-mpi (1.68.6-13build1)

Odnośniki dla murasaki-mpi

Zasoby systemu Trisquel:

Pobieranie pakietu źródłowego murasaki:

Opiekun:

Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)

Original Maintainers:

Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)
Andreas Tille
Nilesh Patra

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]

Podobne pakiety:

homology detection tool across multiple large genomes (MPI-version)

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

This package provides the MPI-enabled binary for murasaki. While this will speed up operation on multi-processor machines it will slow down on a single processor.

Inne pakiety związane z murasaki-mpi

wymaga

poleca

sugeruje

dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

Boost.Iostreams Library
dep: libboost-regex1.74.0-icu70

pakiet wirtualny udostępniany przez libboost-regex1.74.0
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armhf]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
dep: libopenmpi3 (>= 4.1.2)

high performance message passing library -- shared library
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3
dep: murasaki-common

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Pobieranie murasaki-mpi

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	694,4 KiB	3939 KiB	[lista plików]
arm64	665,8 KiB	3666 KiB	[lista plików]
armhf	509,9 KiB	1844 KiB	[lista plików]
ppc64el	721,1 KiB	5074 KiB	[lista plików]

Sections