[ Pakiet źródłowy: miniasm ]
Pakiet: miniasm (0.3+dfsg-3)
Odnośniki dla miniasm
Zasoby systemu Trisquel:
- Install using apturl
- Entry at directory.fsf.org
- Raporty o błędach
- Changelog
- Informacje nt. praw autorskich
Pobieranie pakietu źródłowego miniasm:
Opiekun:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Archiwum e-mail)
- Sascha Steinbiss
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [github.com]
Podobne pakiety:
ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads
Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.
Inne pakiety związane z miniasm
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C Library: Shared libraries
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- compression library - runtime
-
- rec: minimap
- tool for approximate mapping of long biosequences such as DNA reads
Pobieranie miniasm
| Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|
| amd64 | 29,0 KiB | 63 KiB | [lista plików] |
| arm64 | 28,1 KiB | 58 KiB | [lista plików] |
| armhf | 27,7 KiB | 50 KiB | [lista plików] |
| ppc64el | 34,8 KiB | 83 KiB | [lista plików] |