Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> aramo >> science >> hilive
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: hilive  ]

Pakiet: hilive (2.0a-3build3)

realtime alignment of Illumina reads

HiLive is a read mapping tool that maps Illumina HiSeq (or comparable) reads to a reference genome right in the moment when they are produced. This means, read mapping is finished as soon as the sequencer is finished generating the data.

Inne pakiety związane z hilive

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)
    filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
  • dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)
    program options library for C++
  • dep: libc6 (>= 2.27)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
  • dep: liblz4-1 (>= 0.0~r113)
    Fast LZ compression algorithm library - runtime
  • dep: libstdc++6 (>= 9)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
    compression library - runtime

Pobieranie hilive

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 528,2 KiB2420 KiB [lista plików]
arm64 460,7 KiB2216 KiB [lista plików]
armhf 450,5 KiB1478 KiB [lista plików]
ppc64el 538,0 KiB3008 KiB [lista plików]