Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Pakiety >> aramo >> science >> garli-mpi
nabia  ] [  aramo  ]
[ Pakiet źródłowy: garli  ]

Pakiet: garli-mpi (2.1-7)

phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (MPI)

GARLI, Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference is a program for inferring phylogenetic trees. Using an approach similar to a classical genetic algorithm, it rapidly searches the space of evolutionary trees and model parameters to find the solution maximizing the likelihood score. It implements nucleotide, amino acid and codon-based models of sequence evolution, and runs on all platforms. The latest version adds support for partitioned models and morphology-like datatypes.

This version of Garli is using MPI.

Inne pakiety związane z garli-mpi

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie armhf]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
  • dep: libncl2 (>= 2.1.18) [amd64]
    NEXUS Class Library
    dep: libncl2 (>= 2.1.21+git20210811.b1213a7) [nie amd64]
  • dep: libopenmpi3 (>= 4.1.2)
    high performance message passing library -- shared library
  • dep: libstdc++6 (>= 11)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: openmpi-bin
    high performance message passing library -- binaries

Pobieranie garli-mpi

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 524,4 KiB1216 KiB [lista plików]
arm64 520,7 KiB1032 KiB [lista plików]
armhf 531,0 KiB919 KiB [lista plików]
ppc64el 600,5 KiB1236 KiB [lista plików]