Skip to content
Sections
>> Trisquel >> パッケージ >> etiona >> science >> bowtie
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ ソース: bowtie  ]

パッケージ: bowtie (1.2.2+dfsg-2)

bowtie に関するリンク

bowtie

Trisquel の資源:

bowtie ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

Original Maintainers:

  • Debian Med Packaging Team (メールアーカイブ)
  • Steffen Moeller
  • Andreas Tille
  • Ognyan Kulev
  • Stephan Struckmann
  • Alexandre Mestiashvili

外部の資源:

類似のパッケージ:

Ultrafast memory-efficient short read aligner

This package addresses the problem to interpret the results from the latest (2010) DNA sequencing technologies. Those will yield fairly short stretches and those cannot be interpreted directly. It is the challenge for tools like Bowtie to give a chromosomal location to the short stretches of DNA sequenced per run.

Bowtie aligns short DNA sequences (reads) to the human genome at a rate of over 25 million 35-bp reads per hour. Bowtie indexes the genome with a Burrows-Wheeler index to keep its memory footprint small: typically about 2.2 GB for the human genome (2.9 GB for paired-end).

その他の bowtie 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: libc6 (>= 2.14)
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
  • dep: libgcc1 (>= 1:3.4)
    GCC support library
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: libtbb2
    parallelism library for C++ - runtime files
  • dep: python
    interactive high-level object-oriented language (default version)
  • dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
    compression library - runtime
  • sug: bowtie-examples
    Examples for bowtie, the ultrafast memory-efficient short read aligner

bowtie のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 1,646.6 kB7171 kB [ファイル一覧]