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[ ソース: r-cran-sctransform  ]

パッケージ: r-cran-sctransform (0.3.3-1)

Variance Stabilizing Transformations for Single Cell UMI Data

A normalization method for single-cell UMI count data using a variance stabilizing transformation. The transformation is based on a negative binomial regression model with regularized parameters. As part of the same regression framework, this package also provides functions for batch correction, and data correction. See Hafemeister and Satija 2019 <doi:10.1101/576827> for more details.

その他の r-cran-sctransform 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • sug: r-cran-irlba
    GNU R fast truncated SVD, PCA and symmetric eigendecomposition
  • sug: r-cran-knitr
    GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

r-cran-sctransform のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 487.4 kB730 kB [ファイル一覧]
arm64 478.6 kB702 kB [ファイル一覧]
armhf 478.0 kB649 kB [ファイル一覧]
ppc64el 492.3 kB818 kB [ファイル一覧]