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パッケージ: boxshade (3.3.1-14)

boxshade に関するリンク

boxshade

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外部の資源:

類似のパッケージ:

Pretty-printing of multiple sequence alignments

Boxshade is a program for creating good looking printouts from multiple-aligned protein or DNA sequences. The program does not perform the alignment by itself and requires as input a file that was created by a multiple alignment program or manually edited with respective tools.

Boxshade reads multiple-aligned sequences from either PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data and ESEE-save files (limited to a maximum of 150 sequences with up to 10000 elements each). Various kinds of shading can be applied to identical/similar residues. Output is written to screen or to a file in the following formats: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML

その他の boxshade 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
    dep: libc6 (>= 2.7) [armhf]
  • sug: kalign
    Global and progressive multiple sequence alignment
    または clustalw
    global multiple nucleotide or peptide sequence alignment
    または mafft
    Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
    または hmmer
    profile hidden Markov models for protein sequence analysis
  • sug: seaview
    パッケージは利用できません
  • sug: texlive-latex-extra
    TeX Live: LaTeX additional packages
  • sug: xfig
    Facility for Interactive Generation of figures under X11

boxshade のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 53.5 kB165 kB [ファイル一覧]
arm64 51.9 kB160 kB [ファイル一覧]
armhf 51.7 kB135 kB [ファイル一覧]
ppc64el 55.7 kB193 kB [ファイル一覧]