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[ ソース: python-gtfparse  ]

パッケージ: python3-gtfparse (1.2.1+ds-2)

parser for gene transfer format (aka GFF2)

You find a gene in the genome? Or a feature about it? The gene transfer format (GTF, identical to GFF2) allows your program or your database to exchange this information so it can be presented with genome browsers or used e.g. as a selection for other features like nucleotide variants.

This package provides a parser for GTF/GFF2 files, i.e. sets of routines that read that file and support the computational interpretation of these data.

その他の python3-gtfparse 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
  • dep: python3-numpy
    Fast array facility to the Python 3 language
  • dep: python3-pandas
    data structures for "relational" or "labeled" data

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