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[ ソース: tvc  ]

パッケージ: tvc (5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-4build1)

genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms

Torrent Variant Caller (TVC) is a genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms, and is specially optimized to exploit the underlying flow signal information in the statistical model to evaluate variants. Torrent Variant Caller is designed to call single-nucleotide polymorphisms (SNPs), multi-nucleotide polymorphisms (MNPs), insertions, deletions, and block substitutions.

その他の tvc 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • dep: libarmadillo10 (>= 1:10.7.4+dfsg)
    streamlined C++ linear algebra library
  • dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)
    dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
  • dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)
    library for entropy measurement of byte streams
  • dep: libgcc-s1 (>= 4.5)
    GCC support library
  • dep: libjsoncpp25 (>= 1.9.5)
    library for reading and writing JSON for C++
  • dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)
    determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)
  • dep: libstdc++6 (>= 11)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

tvc のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
arm64 1,042.3 kB2844 kB [ファイル一覧]