Paquet source : stacks (2.0Beta8c+dfsg-1)
Liens pour stacks
Ressources Trisquel :
Responsable :
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Archive du courrier électronique)
- Tim Booth
- Andreas Tille
Ressources externes :
- Page d'accueil [creskolab.uoregon.edu]
Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :
- stacks
- pipeline for building loci from short-read DNA sequences
- stacks-web
- web interface for displaying loci from short-read sequences
Autres paquets associés à stacks
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- adep: debhelper (>= 11~)
- helper programs for debian/rules
-
- adep: python
- interactive high-level object-oriented language (default version)
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- adep: zlib1g-dev
- compression library - development
-
- adep: libbam-dev
- manipulates nucleotide sequence alignments in BAM or SAM format
-
- adep: libsparsehash-dev (>= 2.0)
- Google's extremely memory-efficient C++ hash_map implementation
-
- adep: samtools
- processing sequence alignments in SAM and BAM formats
-
- adep: libhts-dev
- development files for the HTSlib
Download stacks
Fichier | Taille (en ko) | Somme MD5 |
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stacks_2.0Beta8c+dfsg-1.dsc | 2,1 ko | c869b570df0e8d40e8732d323daa449e |
stacks_2.0Beta8c+dfsg.orig.tar.xz | 5 863,9 ko | 1e4be67dfe9861da9bf9017aa29772e7 |
stacks_2.0Beta8c+dfsg-1.debian.tar.xz | 9,0 ko | ec8bf8151a610d5f7fea6db08da26ff0 |
- Dépôt Debian des paquets source (VCS: Git)
- https://anonscm.debian.org/git/debian-med/stacks.git
- Dépôt Debian des paquets source (interface web)
- https://anonscm.debian.org/cgit/debian-med/stacks.git