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[ Paquet source : python-cutadapt  ]

Paquet : python3-cutadapt (3.5-1build1)

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python3-cutadapt

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Clean biological sequences from high-throughput sequencing reads (Python 3)

Cutadapt helps with biological sequence clean tasks by finding the adapter or primer sequences in an error-tolerant way. It can also modify and filter reads in various ways. Adapter sequences can contain IUPAC wildcard characters. Also, paired-end reads and even colorspace data is supported. If you want, you can also just demultiplex your input data, without removing adapter sequences at all.

This package contains the Python 3 module.

Autres paquets associés à python3-cutadapt

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • dep: libc6 (>= 2.17)
    GNU C Library: Shared libraries
    un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
  • dep: pigz
    Parallel Implementation of GZip
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
    dep: python3 (<< 3.11)
    dep: python3 (>= 3.10~)
  • dep: python3-dnaio
    Python 3 library for fast parsing of FASTQ and FASTA files
  • dep: python3-xopen (>= 0.5.0)
    Python3 module to open compressed files transparently

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ppc64el 140,4 ko601 ko [liste des fichiers]