Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Paketit >> aramo >> science >> bcalm
nabia  ] [  aramo  ]
[ Source: bcalm  ]

Paketti: bcalm (2.2.3-2)

de Bruijn compaction in low memory

A bioinformatics tool for constructing the compacted de Bruijn graph from sequencing data.

This is the parallel version of the BCALM software using gatb-core library.

Muut pakettiin bcalm liittyvät paketit

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
  • dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2) [amd64]
    dynamic library of the Genome Analysis Toolbox
    dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2+dfsg) [ei amd64]
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)
    GCC support library
  • dep: libhdf5-103-1
    HDF5 C runtime files - serial version
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3

Imuroi bcalm

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri Paketin koko Koko asennettuna Tiedostot
amd64 36.8 kt123 kt [tiedostoluettelo]
arm64 35.9 kt119 kt [tiedostoluettelo]
ppc64el 34.5 kt143 kt [tiedostoluettelo]