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[ Quellcode: velvetoptimiser  ]

Paket: velvetoptimiser (2.2.6-2)

automatically optimise Velvet do novo assembly parameters

VelvetOptimiser is a multi-threaded Perl script for automatically optimising the three primary parameter options (K, -exp_cov, -cov_cutoff) for the Velvet de novo sequence assembler.

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  • hängt ab von
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  • dep: bioperl
    Perl tools for computational molecular biology
  • dep: velvet
    Nucleic acid sequence assembler for very short reads

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