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[ Quellcode: sibsim4  ]

Paket: sibsim4 (0.20-3)

Links für sibsim4

sibsim4

Trisquel-Ressourcen:

Quellcode-Paket sibsim4 herunterladen:

Betreuer:

Original Maintainers:

  • Debian Med Packaging Team (E-Mail-Archiv)
  • Nelson A. de Oliveira
  • Andreas Tille

Externe Ressourcen:

Ähnliche Pakete:

align expressed RNA sequences on a DNA template

The SIBsim4 project is based on sim4, which is a program designed to align an expressed DNA sequence with a genomic sequence, allowing for introns. SIBsim4 is a fairly extensive rewrite of the original code with the following goals:

 * speed improvement;
 * allow large, chromosome scale, DNA sequences to be used;
 * provide more detailed output about splice types;
 * provide more detailed output about polyA sites;
 * misc code cleanups and fixes.

Andere Pakete mit Bezug zu sibsim4

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    GNU C Library: Shared libraries
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.4) [i386]

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Architektur Paketgröße Größe (installiert) Dateien
amd64 29,7 kB71 kB [Liste der Dateien]
i386 31,0 kB71 kB [Liste der Dateien]