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[ Quellcode: seqtk  ]

Paket: seqtk (1.3-2)

Links für seqtk

seqtk

Trisquel-Ressourcen:

Quellcode-Paket seqtk herunterladen:

Betreuer:

Original Maintainers:

  • Debian Med Packaging Team (E-Mail-Archiv)
  • Andreas Tille
  • Brad Chapman

Externe Ressourcen:

Ähnliche Pakete:

Fast and lightweight tool for processing sequences in the FASTA or FASTQ format

Currently, seqtk supports quality based trimming with the phred algorithm, converting fastq to fasta, reverse complementing sequences, extracting or masking subsequences in regions given in a BED/name list file, and more. It contains a subsampling module to sample exactly n sequences or a fraction of sequences.

Seqtk supports both fasta and fastq input files, which can be optionally gzip compressed.

Andere Pakete mit Bezug zu seqtk

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • dep: libc6 (>= 2.29)
    GNU C Library: Shared libraries
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

seqtk herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Paketgröße Größe (installiert) Dateien
amd64 29,5 kB83 kB [Liste der Dateien]
arm64 27,9 kB79 kB [Liste der Dateien]
armhf 27,8 kB63 kB [Liste der Dateien]
ppc64el 32,8 kB151 kB [Liste der Dateien]