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[ Quellcode: sibsim4  ]

Paket: sibsim4 (0.20-5)

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sibsim4

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Ähnliche Pakete:

align expressed RNA sequences on a DNA template

The SIBsim4 project is based on sim4, which is a program designed to align an expressed DNA sequence with a genomic sequence, allowing for introns. SIBsim4 is a fairly extensive rewrite of the original code with the following goals: 

 * speed improvement;
 * allow large, chromosome scale, DNA sequences to be used;
 * provide more detailed output about splice types;
 * provide more detailed output about polyA sites;
 * misc code cleanups and fixes.

Andere Pakete mit Bezug zu sibsim4

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • dep: libc6 (>= 2.17)
    GNU C Library: Shared libraries
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

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ppc64el 31,9 kB85 kB [Liste der Dateien]