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[ Quellcode: libssw  ]

Paket: ssw-align (1.1-13)

Links für ssw-align

ssw-align

Trisquel-Ressourcen:

Quellcode-Paket libssw herunterladen:

Betreuer:

Original Maintainers:

  • Debian Med Packaging Team (E-Mail-Archiv)
  • Sascha Steinbiss
  • Michael R. Crusoe

Externe Ressourcen:

Ähnliche Pakete:

Smith-Waterman aligner based on libssw

This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.

Andere Pakete mit Bezug zu ssw-align

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • dep: libc6 (>= 2.29)
    GNU C Library: Shared libraries
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
  • dep: libssw0 (= 1.1-13)
    fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

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armhf 20,3 kB50 kB [Liste der Dateien]