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[ Quellcode: bcalm  ]

Paket: bcalm (2.2.3-2)

de Bruijn compaction in low memory

A bioinformatics tool for constructing the compacted de Bruijn graph from sequencing data.

This is the parallel version of the BCALM software using gatb-core library.

Andere Pakete mit Bezug zu bcalm

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
  • dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2+dfsg)
    dynamic library of the Genome Analysis Toolbox
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)
    GCC support library
  • dep: libhdf5-103-1
    HDF5 C runtime files - serial version
  • dep: libstdc++6 (>= 5.2)
    GNU Standard C++ Library v3

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Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Paketgröße Größe (installiert) Dateien
arm64 35,9 kB119 kB [Liste der Dateien]