Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакети >> nabia >> science >> samtools
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Източник: samtools  ]

Пакет: samtools (1.10-3)

Връзки за samtools

samtools

Ресурси за Trisquel:

Изтегляне на пакет-източник samtools.

Отговорник:

Original Maintainers:

Външни препратки:

Подобни пакети:

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.

Други пакети, свързани с samtools

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • dep: libc6 (>= 2.29)
    GNU C Library: Shared libraries
    също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
  • dep: libhts3 (>= 1.10)
    C library for high-throughput sequencing data formats
  • dep: libncurses6 (>= 6)
    shared libraries for terminal handling
  • dep: libtinfo6 (>= 6)
    shared low-level terminfo library for terminal handling
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [amd64]
    compression library - runtime
    dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armhf]
  • rec: cwltool
    Common Workflow Language reference implementation
  • rec: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

Изтегляне на samtools

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
amd64 484,8 кБ1146 кБ [списък на файловете]
armhf 457,1 кБ911 кБ [списък на файловете]