Пакет: srst2 (0.2.0-5)
Връзки за srst2
Ресурси за Trisquel:
Изтегляне на пакет-източник srst2.
Отговорник:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Пощенски архив)
- Andreas Tille
Външни препратки:
- Начална страница [katholt.github.io]
Подобни пакети:
Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens
This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.
Други пакети, свързани с srst2
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- dep: cd-hit
- suite of programs designed to quickly group sequences
-
- dep: python
- interactive high-level object-oriented language (default version)
-
- dep: python-biopython
- Python library for bioinformatics (implemented in Python 2)
-
- dep: python-scipy
- scientific tools for Python
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM and BAM formats
-
- rec: python-rpy2
- Python 2 interface to the GNU R language and environment (version 2.8)
Изтегляне на srst2
Архитектура | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
---|---|---|---|
amd64 | 59,1 кБ | 258 кБ | [списък на файловете] |