Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакети >> etiona >> science >> srst2
etiona  ] [  nabia  ] [  aramo  ]
[ Източник: srst2  ]

Пакет: srst2 (0.2.0-5)

Връзки за srst2

srst2

Ресурси за Trisquel:

Изтегляне на пакет-източник srst2.

Отговорник:

Original Maintainers:

Външни препратки:

Подобни пакети:

Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens

This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.

Други пакети, свързани с srst2

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • dep: bowtie2
    ultrafast memory-efficient short read aligner
  • dep: cd-hit
    suite of programs designed to quickly group sequences
  • dep: python
    interactive high-level object-oriented language (default version)
  • dep: python-biopython
    Python library for bioinformatics (implemented in Python 2)
  • dep: python-scipy
    scientific tools for Python
  • dep: samtools
    processing sequence alignments in SAM and BAM formats
  • rec: python-rpy2
    Python 2 interface to the GNU R language and environment (version 2.8)

Изтегляне на srst2

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
amd64 59,1 кБ258 кБ [списък на файловете]