Пакет: sprai (0.9.9.23+dfsg-1)
Връзки за sprai
Ресурси за Trisquel:
Изтегляне на пакет-източник sprai.
Отговорник:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Пощенски архив)
- Afif Elghraoui
Външни препратки:
- Начална страница [zombie.cb.k.u-tokyo.ac.jp]
Подобни пакети:
single-pass sequencing read accuracy improver
Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.
Други пакети, свързани с sprai
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.7)
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
-
- dep: ncbi-blast+ (>= 2.2.27)
- next generation suite of BLAST sequence search tools
-
- dep: perl
- Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
-
- dep: time
- GNU time program for measuring CPU resource usage
-
- sug: make
- utility for directing compilation
също и виртуален пакет, предлаган от make-guile
-
- sug: pbalign
- map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences
-
- sug: pbgenomicconsensus
- Pacific Biosciences variant and consensus caller
-
- sug: pbh5tools
- tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files
Изтегляне на sprai
Архитектура | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
---|---|---|---|
amd64 | 1 479,6 кБ | 1701 кБ | [списък на файловете] |
i386 | 1 478,7 кБ | 1699 кБ | [списък на файловете] |