Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакети >> etiona >> science >> sprai
etiona  ] [  aramo  ]
[ Източник: sprai  ]

Пакет: sprai (0.9.9.23+dfsg-1)

Връзки за sprai

sprai

Ресурси за Trisquel:

Изтегляне на пакет-източник sprai.

Отговорник:

Original Maintainers:

Външни препратки:

Подобни пакети:

single-pass sequencing read accuracy improver

Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.

Други пакети, свързани с sprai

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • dep: libc6 (>= 2.7)
    GNU C Library: Shared libraries
    също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
  • dep: ncbi-blast+ (>= 2.2.27)
    next generation suite of BLAST sequence search tools
  • dep: perl
    Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
  • dep: time
    GNU time program for measuring CPU resource usage
  • sug: make
    utility for directing compilation
    също и виртуален пакет, предлаган от make-guile
  • sug: pbalign
    map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences
  • sug: pbgenomicconsensus
    Pacific Biosciences variant and consensus caller
  • sug: pbh5tools
    tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files

Изтегляне на sprai

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
amd64 1 479,6 кБ1701 кБ [списък на файловете]
i386 1 478,7 кБ1699 кБ [списък на файловете]