Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакети >> etiona >> science >> sambamba
etiona  ] [  aramo  ]
[ Източник: sambamba  ]

Пакет: sambamba (0.6.7-2)

Връзки за sambamba

sambamba

Ресурси за Trisquel:

Изтегляне на пакет-източник sambamba.

Отговорник:

Original Maintainers:

Външни препратки:

Подобни пакети:

tools for working with SAM/BAM data

Sambamba positions itself as a performant alternative to samtools and provides tools for

 * Powerful filtering with sambamba view --filter
 * Picard-like SAM header merging in the merge tool
 * Optional for operations on whole BAMs
 * Fast copying of a region to a new file with the slice tool
 * Duplicate marking/removal, using the Picard criteria

Други пакети, свързани с sambamba

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • dep: libbiod0
    bioinformatics library in D
  • dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
    GNU C Library: Shared libraries
    също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
    dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]
  • dep: libhts2 (>= 1.4.1)
    C library for high-throughput sequencing data formats
  • dep: liblz4-1 (>= 0.0~r127)
    Fast LZ compression algorithm library - runtime
  • dep: libphobos2-ldc-shared78
    LLVM D Compiler - Phobos2 Standard library, shared objects
  • dep: libundead0
    Obsolete Phobos modules upgraded to work with the latest D

Изтегляне на sambamba

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
amd64 501,6 кБ2362 кБ [списък на файловете]
i386 521,9 кБ2492 кБ [списък на файловете]