Пакет: murasaki-common (1.68.6-6build5)

Връзки за murasaki-common

Ресурси за Trisquel:

Изтегляне на пакет-източник murasaki.

Отговорник:

Ubuntu Developers (Пощенски архив)

Original Maintainers:

Debian Med Packaging Team (Пощенски архив)
Andreas Tille

Външни препратки:

Начална страница [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]

Подобни пакети:

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

This package contains all files that are common to the single core murasaki package and the multi core murasaki-mpi package.

Други пакети, свързани с murasaki-common

зависимости

препоръчани

предложени

dep: gnuplot

Command-line driven interactive plotting program.
също и виртуален пакет, предлаган от gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

или gnuplot5

виртуален пакет, предлаган от gnuplot
dep: imagemagick

image manipulation programs -- binaries
също и виртуален пакет, предлаган от graphicsmagick-imagemagick-compat, imagemagick-6.q16
dep: libbio-perl-perl

BioPerl core perl modules
dep: r-cran-rocr

GNU R package to prepare and display ROC curves

rec: libterm-readkey-perl

perl module for simple terminal control
rec: libtext-wrapi18n-perl

internationalized substitute of Text::Wrap

или libtext-wrapper-perl

simple word wrapping routine

Изтегляне на murasaki-common

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
all	139,6 кБ	427 кБ	[списък на файловете]

Sections