[ Източник: miniasm ]
Пакет: miniasm (0.2+dfsg-2)
Връзки за miniasm
Ресурси за Trisquel:
Изтегляне на пакет-източник miniasm.
Отговорник:
Original Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (Пощенски архив)
- Sascha Steinbiss
Външни препратки:
- Начална страница [github.com]
Подобни пакети:
ultrafast de novo assembler for long noisy DNA sequencing reads
Miniasm is an experimental very fast OLC-based de novo assembler for noisy long reads. It takes all-vs-all read self-mappings (typically by minimap) as input and outputs an assembly graph in the GFA format. Different from mainstream assemblers, miniasm does not have a consensus step. It simply concatenates pieces of read sequences to generate the final unitig sequences. Thus the per-base error rate is similar to the raw input reads.
Други пакети, свързани с miniasm
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.4) [i386]
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- compression library - runtime
-
- rec: minimap
- tool for approximate mapping of long biosequences such as DNA reads
Изтегляне на miniasm
| Архитектура | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
|---|---|---|---|
| amd64 | 28,6 кБ | 70 кБ | [списък на файловете] |
| i386 | 29,5 кБ | 70 кБ | [списък на файловете] |