Пакет: pbalign (0.3.0-1)

Връзки за pbalign

Ресурси за Trisquel:

Изтегляне на пакет-източник pbalign.

Отговорник:

Debian Med Packaging Team (Пощенски архив)

Original Maintainers:

Debian Med Packaging Team (Пощенски архив)
Afif Elghraoui

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences

pbalign aligns PacBio reads to reference sequences, filters aligned reads according to user-specific filtering criteria, and converts the output to either the SAM format or PacBio Compare HDF5 (e.g., .cmp.h5) format.

This package is part of the SMRTAnalysis suite.

Други пакети, свързани с pbalign

зависимости

препоръчани

предложени

dep: blasr (>= 5.3+0)

mapping single-molecule sequencing reads
dep: python

interactive high-level object-oriented language (default version)
dep: python-pbalign

map Pacific Biosciences reads to reference DNA sequences (Python2)
dep: python-pkg-resources

Package Discovery and Resource Access using pkg_resources

rec: hdf5-tools

Hierarchical Data Format 5 (HDF5) - Runtime tools
rec: python-pbh5tools

tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files -- Python 2 library

sug: bowtie2

ultrafast memory-efficient short read aligner
sug: gmap

Пакетът не е наличен
sug: pbalign-doc

documentation for pbalign

Изтегляне на pbalign

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
all	6,9 кБ	33 кБ	[списък на файловете]

Sections