Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакети >> aramo >> science >> seqmagick
nabia  ] [  aramo  ]
[ Източник: seqmagick  ]

Пакет: seqmagick (0.8.4-3)

Връзки за seqmagick

seqmagick

Ресурси за Trisquel:

Изтегляне на пакет-източник seqmagick.

Отговорник:

Original Maintainers:

Външни препратки:

Подобни пакети:

imagemagick-like frontend to Biopython SeqIO

Seqmagick is a little utility to expose the file format conversion in BioPython in a convenient way.

Features include:

 * Modifying sequences:
   - Remove gaps
   - Reverse & reverse complement
   - Trim to a range of residues
   - Change case
   - Sort by length or ID
 * Displaying information about sequence files
 * Subsetting sequence files by:
   - Position
   - ID
   - Deduplication
 * Filtering sequences by quality score
 * Trimming alignments to a region of interest defined by the forward
   and reverse primers

Други пакети, свързани с seqmagick

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
  • dep: python3-biopython
    Python3 library for bioinformatics
  • dep: python3-pygtrie
    Python library implementing a trie data structure (Python 3)

Изтегляне на seqmagick

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
all 40,4 кБ223 кБ [списък на файловете]