Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакети >> aramo >> libs >> libhts3
nabia  ] [  nabia-updates  ] [  aramo  ]
[ Източник: htslib  ]

Пакет: libhts3 (1.13+ds-2build1)

Връзки за libhts3

libhts3

Ресурси за Trisquel:

Изтегляне на пакет-източник htslib.

Отговорник:

Original Maintainers:

Външни препратки:

Подобни пакети:

C library for high-throughput sequencing data formats

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension ‘csi’ (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

Други пакети, свързани с libhts3

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • dep: libbz2-1.0
    high-quality block-sorting file compressor library - runtime
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
    също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
  • dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)
    easy-to-use client-side URL transfer library (GnuTLS flavour)
  • dep: libdeflate0 (>= 1.0)
    fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression
  • dep: libhtscodecs2 (>= 1.1.1)
    Custom compression for CRAM and others
  • dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
    XZ-format compression library
  • dep: libssl3 (>= 3.0.0~~alpha1)
    Secure Sockets Layer toolkit - shared libraries
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime

Изтегляне на libhts3

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
amd64 380,6 кБ943 кБ [списък на файловете]
arm64 369,1 кБ870 кБ [списък на файловете]
armhf 337,8 кБ614 кБ [списък на файловете]
ppc64el 493,8 кБ1499 кБ [списък на файловете]