Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакети >> aramo >> python >> python3-cyvcf2
nabia  ] [  aramo  ]
[ Източник: cyvcf2  ]

Пакет: python3-cyvcf2 (0.30.14-1build1)

Връзки за python3-cyvcf2

python3-cyvcf2

Ресурси за Trisquel:

Изтегляне на пакет-източник cyvcf2.

Отговорник:

Original Maintainers:

Външни препратки:

Подобни пакети:

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Други пакети, свързани с python3-cyvcf2

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • dep: libc6 (>= 2.7)
    GNU C Library: Shared libraries
    също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
  • dep: libhts3 (>= 1.10)
    C library for high-throughput sequencing data formats
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
    dep: python3 (<< 3.11)
    dep: python3 (>= 3.10~)
  • dep: python3-click
    Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
  • dep: python3-coloredlogs
    colored terminal output for Python 3's logging module
  • dep: python3-numpy (>= 1:1.20.0)
    Fast array facility to the Python 3 language
  • dep: python3-numpy-abi9
    виртуален пакет, предлаган от python3-numpy

Изтегляне на python3-cyvcf2

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
armhf 794,9 кБ4455 кБ [списък на файловете]