Skip to content
Sections
>> Trisquel >> Пакети >> aramo >> science >> gsort
aramo  ]
[ Източник: gsort  ]

Пакет: gsort (0.1.4-3)

sort genomic data

gsort is a tool to sort genomic files according to a genomefile. For example, to sort VCF to have order: X, Y, 2, 1, 3, ... and the header needs to be kept at the top.

As a more likely example, if a file nneds to be sorted to match GATK order (1 ... X, Y, MT) which is not possible with any other sorting tool. With gsort one can simply place MT as the last chrom in the ".genome" file.

It will also be useful for getting files ready for use in bedtools.

Други пакети, свързани с gsort

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • dep: libc6 (>= 2.32)
    GNU C Library: Shared libraries
    също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

Изтегляне на gsort

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
arm64 1 452,8 кБ4964 кБ [списък на файловете]